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最新成果:分子動(dòng)力學(xué)模擬可提高質(zhì)譜儀檢測(cè)精度

2021-01-27 14:20閱讀數(shù):1457

       質(zhì)譜儀(MS)具有快速識(shí)別樣品中化學(xué)成分的能力,如放射性碳定年、蛋白質(zhì)分析和監(jiān)測(cè)藥物代謝等,已經(jīng)成為化學(xué)和生物實(shí)驗(yàn)室中必不可少的工具,用于各種實(shí)驗(yàn)。

  質(zhì)譜儀器的工作原理是給分析物分子一個(gè)電荷,然后讓其通過一個(gè)均勻電場(chǎng)的空間區(qū)域,電場(chǎng)使它們的軌跡彎曲成一個(gè)圓。該圓的半徑,取決于分子質(zhì)量與電荷的比例,被檢測(cè)并與已知樣品進(jìn)行比較。這種方法只能測(cè)量這個(gè)比例,而不能測(cè)量質(zhì)量本身,過量的電荷會(huì)導(dǎo)致結(jié)果不準(zhǔn)確或模糊。

  現(xiàn)在,日本金澤大學(xué)的研究人員使用了一種強(qiáng)大的分子動(dòng)力學(xué)模擬來更好地理解過量電荷對(duì)由質(zhì)譜測(cè)試的分子的影響。

  研究人員模擬了添加相反電荷的分子以中和過量電荷的效果。在這種情況下,聚乙二醇上的正電荷可以通過與帶負(fù)電荷的NO2-離子碰撞而減少。然而,由于碰撞的可能性首先取決于電荷的數(shù)量,這一事實(shí)使情況變得復(fù)雜。研究人員表示,在少量過量電荷的情況下,聚乙二醇呈現(xiàn)致密形式。然而,隨著電荷的增加,正電荷之間的相互排斥導(dǎo)致它變直。

  為了幫助加快計(jì)算速度,研究小組使用了“連續(xù)體近似”方法,只有當(dāng)NO2-分子接近聚乙二醇時(shí),才開始模擬它的所有原子。

  這一研究成功表明,混合連續(xù)分子動(dòng)力學(xué)模擬可以更廣泛地用于研究碰撞驅(qū)動(dòng)的反應(yīng),分子可以采取不同的構(gòu)象。這一成果可以催生更有效的方法來控制樣品分子中的過量電荷,從而獲得更準(zhǔn)確的結(jié)果。

  研究成果已發(fā)表在《化學(xué)物理以及物理化學(xué)》(Phys。 Chem。 Chem。 Phys。, PCCP)上。

(來源:阿儀網(wǎng))

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